Die SKFIT kooperiert an der Universität zu Lübeck und dem UKSH mit:

• Interdisziplinäres Centrum für Biobanking-Lübeck (ICB-L)
• Institut für Medizinische Informatik (IMI)
• IT Service Center (ITSC)
• Zentrum für Klinische Studien (ZKS)
• Zentrum für Bevölkerungsmedizin und Versorgungsforschung (ZBV)
• UKSH IT Service Gesellschaft mbH (UKSH ITSG).

Die Mitarbeiter der SKFIT sind aktiv tätig in nationalen und internationalen Arbeitsgruppen:

• National: Deutsche Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie e.V. (GMDS), Technologie- und Methodenplattform für die vernetzte medizinische Forschung e.V. (TMF), , German Biobank Node (GBN), Gesellschaft für Informatik e.V. (GI)
• International: International Society for Biological and Environmental Repositories (ISBER), European and Middle Eastern Society for Biopreservation and Biobanking (ESBB), Health Level Seven (HL7), der Biobanking and Biomolecular Resources Research Infrastructure (BBMRI)